Salonu su 614. godine Avari i naši preci razorili, zajedno s nadgrobnom pločom sv. Duje čiji je ulomak u Arheološkom muzeju. Izbjeglice iz Salone izbacili su Dioklecijanov sarkofag i kosti iz Mauzoleja da u njega stave Dujmove kosti, ali ne sve.
Naime, 641. je zabrinuti papa Ivan IV. zatražio da se manje relikvije mučenika iz Dalmacije i Istre prebace u Rim. Tako su Sv. Duji rastavili kostur, veći je dio ovdje, a manji preko Jadrana.
S vremenom je Mauzolej pretv...