Nogometaši Rijeke u 3. će pretkolu Europske lige ugostiti grčki Aris iz Soluna ili ukrajinsku Kovalivku, Lokomotiva će u istoj fazi natjecanja gostovati kod mađarskog Honveda ili švedskog Malomoa, Hajduk će u slučaju prolaska Renove u goste azerbajdžanskom Neftčiju ili turskom Galatasarayu, dok će Osijek ukoliko svlada Basel ugostiti ciparski Anorthosis, odlučeno je na ždrijebu u Nyonu.
Susreti 3. pretkola igrat će se 24. rujna, a pobjednici će se plasirati u posljednje, 4. pretkolo Europske lige.
Igrat će se samo jedan dvoboj. U slučaju da nakon 90 minuta rezultat bude neodlučen, igrat će se produžetak od pola sata, a ako i nakon tih dodatnih 30 minuta bude neodlučeno o putniku u sljedeće pretkolo odlučivat će 11-erci.